Une introduction à la biostatistique

Preface

Préface Des chercheurs ont essayé pendant plusieurs années de découvrir le sens des derniers mots de Hamlet : ≪ Tout le reste est silence ?≫ dans la pièce de théâtre de Shakespeare. Dans un film de 2007 du même titre, dans la ville de Bucharest en 1911, un acteur âgé de 19 ans décide de devenir un réalisateur de film (un rêve utopique à l’époque), après qu’il réalise que le cinéma peut sauvegarder la magie des performances de théâtre pour l’éternité. Ce livre fut créé du désir de trouver une réponse à la même question, à laquelle nous faisons face à la fin de chaque semestre lorsque nous terminons d’enseigner un cours. Serait-il possible de sauvegarder, pour des générations futures d’étudiants, certaines parties de l’atmosphère vibrante de la salle de classe et de leur partager cette expérience incroyable ? Ce manuscrit fut développé par les auteurs des notes de cours pour le cours MAT 2779 ≪ Introduction à la biostatistique≫ (et le cours équivalent MAT 2778 ≪ Probabilités et statistique pour les sciences naturelles≫), qui furent enseignés à l’Université d’Ottawa depuis 2003 jusqu’à présent. Pendant ces années, ces notes ont constamment évoluées et ont été enrichies avec plus d’exemples, un processus qui continuera sans doute au cours des années à venir. Cependant, la plupart des exemples qui sont inclus dans ce livre sont nouveaux et n’ont pas été utilisés en salle de classe avant maintenant. Sauf si une source d’information spécifique est mentionnée, tous les exemples du livre utilisent des données hypothétiques. Les exemples sont habituellement basés sur une situation de la vie quotidienne, qui est connectée d’une façon très simple aux sciences naturelles. Des données générées par des logiciels sont évitées, et les résultats de simulations ne sont pas discutés. viii Prévoir l’imprévisible – Une introduction à la biostatistique Le but de ce livre est d’introduire et d’explorer l’utilité de diverses méthodes statistiques et probabilistiques, par l’entremise d’exemples simples et non-techniques, permettant au lecteur de comprendre rapidement les nouveaux concepts et de les appliquer à des situations plus complexes plus tard. Quelques exemples utilisés dans le livre attirent l’attention sur divers problèmes du monde d’aujourd’hui, liés à des problèmes environnementaux , au changement climatique, à la perte de biodiversité et à leur impact sur la faune et la population humaine. Le livre est divisé en deux parties. La partie I introduit les concepts fondamentaux et les règles de la théorie des probabilités, tandis que la partie II se concentre sur les statistiques. Cet ordre réflète la philosophie des auteurs que la théorie des probabilités se situe au fondement de la statistique et qu’il est important de comprendre le sens du hasard avant d’effectuer toute analyse de données. Ceci explique pourquoi le sujet des statistiques descriptives est discuté seulement dans la partie II, et non au début tel qu’il semble être la pratique commune lors de l’enseignement de la statistique. Dans une adresse par Raymond Pearl à la Société Statistique Américaine en 1914, intitulée ≪ Le Service et l’Importance des Statistiques à la Biologie ≫, il mentionna trois contributions importantes des méthodes statistiques à la biologie : (i) pour décrire un groupe d’individus en termes des attributs et des qualités du groupe ; (ii) pour mesurer la précision d’une estimation avec un haut niveau de confiance ; (iii) pour mesurer le degré d’association entre les variations d’une série de caractères ou d’événements (voir [46]). Ces trois méthodes fondamentales sont discutées en longueur dans ce manuel. La biostatistique représente un sujet interdisciplinaire qui se situe à l’intersection de la biologie et de la statistique, et qui consiste de l’étude des méthodes quantitatives ou statistiques appliquées à la biologie. Ce sujet a une histoire récente, ses origines datant de Francis Galton, un cousin de Charles Darwin, qui était intéressé par le problème d...